Una bona manera d'estimar l'estat d'un ecosistema és conèixer la densitat de població que hi tenen certs organismes, considerats com a indicadors del conjunt del sistema biològic. L'ús d'indicadors abarateix l'aplicació de programes de gestió ambiental.
Els indicadors de biodiversitat s’anomenen bioindicadors. Quan les poblacions d’una espècie són sensibles a les modificacions que presenta un medi, aquesta espècie queda acreditada com a indicador de qualitat ambiental o biomarcador.